A mi me ocurrió exactamante lo mismo con una Abit NF7-S. Como tú hice de todo, busque por todos lados y probé de todo.
Al final lo solucioné desactivando en la bios un parámetro, el cual ahoramismo no recuerdo, pero que te lo busco en un periquete 
Luego edito.
EDITADO: No encuentro la opción de marras, pero creo recordar que era algo relacionado con el ACPI. Prueba a ver que tal.
Caso resuelto, el HD donde estaba windows acaba de morir 
Buenas.
Os comento un problema que tengo con windows XP:
Este ordenador corre Gentoo Linux un 90% del tiempo, pero de vez en cuando me gusta darle al vicio de los juegos, asi que tenía instalado un windows XP en 4 particiones (Sistema O., Juegos, Datos y una Fat32 de intercambio con Linux).
Hacía tiempo que no arrancaba el Xp y el otro dia quise hacerlo. Al arrancar me salió la pantalla en la que te informa que windows se cerró de forma incorrecta y te da varias opciones. Como no recordaba haber cerrado mal ni con errores le dije que arrancara normalmete. Al hacerlo aparece un cursor parpadeando en la esquina superior izquierda y el resto de la pantalla en negro, y el ordenador deja de responder incluso al teclado. Reseteé y volví a intentarlo en modo seguro y volvió a pasar lo mismo.
Lo siguiente que intenté fue arrancar con el CD del XP y usar la consola de recuperación, pero una vez ha cargado todo los archivos que necesita, al pasar a la parte donde te da a elegir entre instalar o reparar, vuelve a pasar lo mismo: Cursor parpadeando y ordenador frito.
Asi que empiezo a pensar en algo de Hardware, por lo que cargo Linux (sin el más mínimo problema) y hago una serie de pruebas para ver que tal va:
Como veo que todo es correcto sospecho del único componente que no comparten los dos S.O.: Un disco duro en el que sólo estaba el XP. Así que desde linux monto las particiones de XP e incluso las leo sin el más mínimo problema. No contento con ello, hice una copia de seguridad de los datos del XP, arranque el equipo con un CD de segate (marca del disco duro) y le pasé una utilidad para comprobar el estado del HD. No me dió ningún error, pero el problema seguia persistiendo. Así que como tenía un backup lo formatee a bajo nivel y volví a pasarle la utilidad, lo particioné de nuevo y volví a pasarle la utilidad. Todo esto sin errores.
Al volver a intentar instalar Xp me vuelve a pasar lo mismo, asi que falto ya de ideas lo intento con Win98, instalandose este sin el más mínimo problema, y funcionando perfectamente.
Asi que por mi parte con Win98 funcionando y con las ideas agotadas, me rindo de momento. Si alguno tiene una idea de qué puede estar pasando le estaría muy agradecido.
Por cierto el equipo es:
Placa madre Abit NF7 2.0 (Nforce 2)
Micro AMD Tbred B 2100+@2000 reales (166x12, como veis es un OC muy suave, no creo que sea por esto)
Memoria OCZ 512 Mb 266mhz
GF 4 Ti4600 sin OC
Disco duro Segate 40Gb master (el de XP)
DVD LG esclavo
Segate 80 Gb master (Linux)
Grabadora Liteon esclavo
No confundamos conceptos. Linux en sí sólo es el núcleo, y este siempre será "compatible", ya que es el mismo para todos. Otra cosa son las distintas distribuciones con sus distintos tipos de paquetes, distinta filosofia, distintos direcctorios, etc…
Siempre podrás instalar un binario, el cual da igual en que distribución lo hagas ya que será el mismo. Asi que hablar de incompatibilidades entre linux no es del todo correcto, aunque si lo sería si hablasemos de sistemas de paquetes de distintas distribuciones.
Gentoo sin duda alguna. Y lo dice un Debianero con 5 años de disfrutarlo.
Pero fué probar una Gentoo en un Pentium II 400 Mhz y 256 de ram y me quedé encantado: Instalas lo básico para un arranque y después vas metiendo lo que te interesa, de forma facil, actualizada y con todas las dependencias; sistema de paquetes cojonudo (de lo mejor junto con el de Debian); se adapta a tu equipo como un guante y se aprende muuucho, ya que tienes que configurarlo todo.
A mi me convenció y me he pasado a Gentoo (con gran pena por dejar mi Woodie).
El problema es que el foco no pasa al programa que ejecutais, sino que se queda en el sitio desde el que lanzais el juego.
A mi me ha pasado con algunos juegos, y después de darle algunas vueltas llegué a la conclusión de que no tiene solución inmediata, y como tampoco tengo mucho tiempo…. :susto:
Hay que usar la que viene con el ejecutable, que ya esta actualizado.
Ya me llegó la placa (por fin) y he podido pinchar el micro.
En un principio (y sin extenderme demasiado que me voy a la calle):
AMD XP Tbred B 2100+ (1.700 reales) AUIHB de la semana 50
512 Mb OZC 333 Cas 2.5
Abit NF7-S
Para empezar puse la memoria a 6-2-2-2-2 y el bus a 166. Con el multiplicador a 13 (2700+) no llegaba a arrancar windows (un poco bestia ponerlo del tiron). Asi que baje el multi a 12.5. Estable como una roca y 33º en full (es la primera bios de Abit, la cual creo que mide mal la temp). Despues le subi el Vcore y a 1.70 y 13 x 166 ya era estable.
Ahora me queda jugar con la memoria e intentar subir el FSB, aunque con esto ya estaré forzando la memoria.
En resumen que tengo prisa: de 1729 (13x133) a 2075 (12.5x166) sin tocar voltajes y sin inmutarse. 33 grados en full.
Solo he probado por ahora con el 3dmark –> 13500 con una GF4 Ti 4600 sin overclock y el sandra en la prueba de la CPU --> Alu 7519 y FPU 3102
Cuando tenga tiempo me meteré con FSB y voltajes, ademas quiero actualizar la bios y hacer mas pruebas. Pero como introducción vale ¿No? 
Yo tengo uno.
AXDA2100DUT3C
AIUHB 0250XPPW
El problema es que la Abit que pedi vino defectuosa y hasta el Miercoles no podré pincharlo
A mi me llega el Lunes (tuve que devolverla por que la primera estaba defectuosa), y también tengo un 2100+ AUIHB esperando, asi que cuando te llegue la placa no te cortes a la hora de postear resultados.