El proceso de chequeo debiera tardar sólo unos segundos. Otra cosa que puedes probar es a desconectar totalmente todos los dispositivos (discos duros, unidades ópticas, tarjeta de sonido, …) a excepción de la gráfica y el teclado.
Por otro lado, en las placas Epox que he manejado cuando termina el proceso de chequeo correctamente aparece 'FF' en el 'display' ese. Como te señalé en mi primera respuesta, fíjate en las distintas letras y números que van saliendo y si alguna de ellas se queda fijo mucho tiempo. Quizás por ahí sepamos a qué es debido esa tardanza.
Respecto a la actualización del BIOS. En este enlace se inicia la descarga de la última versión disponible:
http://www.epox.com/USA/download.asp?link=w22So2q23L2w3aa00B0C0Z0bv0V2t2P2J1W01B0c3a3Om3w00ef1O3r00dA10i3QM0d10Zo3R0F1H00BE11B0S0rd03rt1h22h1gM3u2b11B2Ns22Qt2v2q3K0K0r0&function=download&id=1484
Se trata de un ejecutable que descomprimirá varios archivos a un disquete (te propone la unidad A: de forma predeterminada; no la cambies). En uno de esos archivos, llamado readme.txt, vienen instrucciones precisas para la actualización. De todas formas, si inicias el sistema con un disco de arranque (ms-dos o freedos), cuanto te salga el 'prompt' (A:>), mete el disquete con el BIOS y escribe este comando:
update
Es un archivo de proceso por lotes (batch) que actualizará el BIOS de forma automatizada.