Puedes poner un disco SATA en esa placa base, no hay problema. Y para mi el procesador si merece la pena, porque ahí es donde tienes el mayor cuello de botella. Tienes RAM suficiente, con 2 discos duros (1 dedicado) tienes suficiente, pero CPU no. Los tiempos de espera serán por la CPU. Gastar un 10% más en un ordenador para obtener un 10% más de rendimiento me parece más que aceptable. Un Q6600 cuesta unos 500€, es algo caro, pero si los programas que usas son multihilo puedes duplicar rendimiento.