Eso es totalmente normal cuando está activado el ACPI, y así está diseñado. Casi todo lo que tengo yo conectado comparte la IRQ 11 y no tengo el más mínimo problema. Si alguna vez hubo algo raro, no era culpa de eso.
Y si alguien se empeña en que no sea así, pues ya sabe, a ingeniárselas para desactivar el ACPI….
Y por cierto, procurad los que tengáis una placa base con controladora RAID integrada (si la usáis) no pinchar ninguna tarjeta en la ranura que comparte IRQ con dicha controladora (suele venir especificado en el manual). Y si no es posible (porque todo está ocupado) asegurarse de que la tarjeta está diseñada para compartir IRQ.