Hola, yo tengo el mismo problema desde hace aproximadamente una semana. Un cliente me llamó diciéndome que recibe un mensaje de disco duro lleno cuando intenta guardar los cambios en algún archivo ubicado en unidad de red. El servidor tiene Windows 2008 Server R2 Foundation y 1,3TB libres.
La administración de cuota estaba desactivada, yo la activé pero sin límite y el problema parece que se solucionó, pero una semana después me vuelve a llamar diciendo que le ocurre lo mismo.
El usuario tiene permisos totales en la carpeta.