¿Has comprobado que no sea un mal contacto del conmutador?
Es posible también que pueda ser la misma placa base del que no te funcione que no acepte de buen grado ese cambio e incluso el sistema operativo que tengas.
Por lo que dices supongo que sólo falla cuando haces el cambio, antes si no?
Supongo lógicamente que las conexiones del teclado y ratón tendrán contactos distintos en el conmutador, puedes probar a cambiar el uno por el otro y comprobar de ésta manera que no sea el conmutador.
Otra comprobación que puedes hacer, es conectar el ratón que no te funciona directamente al ordenador con el que no te funciona una vez reiniciado el sistema operativo.
O bien otra, conmuta en la posición que no te funciona pero con ese ordenador apagado y reinicia después por si puede ser un problema de detección del ratón.
Prueba también a ir cambiando ratón y teclado directamente de un PC a otro. En definitiva, a intentar aislar el problema si es que realmente lo tienes o bien es una incompatibilidad.