Pensando que podría ser un problema de configuración de tu máquina, acabo de comprobar atónito como tienes razón, ya que no tenía constancia de ello. El sonido integrado AC'97 Realtek ALC650 de 6 canales (5.1), deja de funcionar cuando se establecen los 37Mhz en los PCI.
Esto puede ser un gran "contratiempo", ya que multitud de placas base incorporan este chip de audio. Yo concretamente, tengo tu misma placa, pero en su primera versión. He actualizado los drivers del sonido integrado (cosa áltamente recomendable ya que incorporan notables mejorías), pero el problema sigue persistiendo.
Lo que no entiendo es tú necesidad de subir la frecuencia de los PCI. A ver si lo explicas para que podamos ayudarte.