No estoy muy puesto en el tema de ventiladores, pero creo que el mio es bastante bueno por un par de razones.
1- Es Enermax y creo que esta no es mala marca.
2- Tiene un potenciometro para regular la velocidad, aunque también puedes hacer esto si tu placa es compatible con el programa 'SpeedFan' y va conectado el ventilador a la placa.
Está claro que el que tu caja tenga partes muy pegadas a la mesa es una pega, y en ese caso si que es muy posible que ganes algo cambiando la posición. De hecho algo parecedo es lo que me hizo cambiar al formato microATX, porque mi caja estaba encajonada en la mesa y habia que hacer fuerza para sacarla.
El espacio que tienes al lado de la tarjeta gráfica te podría servir para meter un blower, que no es otra cosa que un estractor de aire y en ese caso sacaria el aire caliente que se disipa de la zona del micro. Hay gente que lo pondría entre la tarjeta grafica y la de TV para sacar el calor del procesador de la gráfica. De todos modos ya me has dicho que tienes sitio para un ventilador en la parte de atrás y no te haría falta esto, que a veces podría ser un estorbo ya que no se suelen quedar muy rigidos en su sitio y podria tocar con alguna tarjeta, metiendo mas ruido por las vibraciones. Su ventaja es que son más silenciosos.