¿Se han divorciado mi placa y mi fuente?

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Esto si que nunca me había pasado. Mi placa y mi fuente no quieren saber nada la una con la otra pero por separado funcionan perfectamente. Desde el 17/01/2007 que monté el equipo nunca había tenido ningún problema. Decidí cambiar el ventilador del procesador y el pc ha dejado de funcionar. Ahora mismo tengo la placa desmontada de la torre y solo con el procesador, el ventilador original del procesador, la Ram y la fuente conectada. Al encender se mueve el ventilador de la fuente y de la cpu y transcurrido un segundo se apaga. A los 5 segundos y de forma automática intenta arrancar otra vez girando los ventiladores de nuevo por un segundo y se vuelve a apagar y así hasta que apago la fuente. Si no le conecto el ATX de 12v el equipo arranca pero no tengo señal de video. He cambiado la Ram, he comprobado todo lo que se me ha ocurrrido. He medido con un multímetro cada cable de la fuente y está todo correcto. Para comprobar que la fuente de alimentación estaba bien se la he conectado a otro equipo y el equipo arranca y funciona a la primera y aprovechando la fuente de este segundo equipo se la he conectado a mi equipo y mi equipo va perfectamente. Los dos equipos funcionan perfectos pero si vuelvo a conectar mi fuente a mi placa entonces no arranca. ¿Dónde está el problema? No lo entiendo.
Procesador: E6400
Placa: Gigabyte 965p-dq6 atx s.775
Fuente: Be-quiet straight 600w

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Desconecta completamente de la fuente, acto seguido pulsa repetidamente el boton de arranque (para descargar), y resetea la bios o dejala sin pila unos minutos bien largos.
Prueba con eso a ver si cambia algun detalle del funcionamiento.

Alguna pequeña diferencia deve de haber entre las pruebas fallidas y las exitosas ademas del cambio de fuente, parece ser que la fuente sospechosa pasa a funcionar bien cuando esta fuera de la caja ¿podria ser?.

Tambien es bastante posible que sin darte cuenta hayas creado algun cortocircuito en un punto cualquiera de la placa base (tanto por la cara delantera como por la trasera), asi que todas las pruebas que hagas con tu hardware hazlas en igualdad de condiciones, y revisa con lupa el montaje del disipador, si necesario vuelve a montarlo lentamente.

Salu2.

PD: Tambien se me ocurre que el conector ATX 12v haga mal contacto por lo que dices de que sin el arranca, ¿usas alguna prolongacion para ese conector?
¿Y que ventilador has cambiado?