Dos cosas:
1ª Las lecturas de voltajes que obtienes a través de programas de monitorización no son fiables en absoluto, se basan en los valores que les ofrece el chipset de la MoBo, pero éstos pueden tener desviaciones de 0.3 V o más y eso es inaceptable. Consigue un polímetro digital y haz las medidas con él, verás qué diferencia. Si quieres hacerlas todas saca la fuente de la caja, ábrela, y entonces conéctala al PC y haz funcionar la máquina. Así podrás medir cualquier valor.
2º Fluctuaciones en los voltajes de hasta +/- 5% son considerados tolerables por todos los fabricantes. Eso implica que valores entre 11.4 y 12.6 V son perfectamente válidos para el raíl de 12 V, por ejemplo.
Salu2