Los ordenadores no son silenciosos por naturaleza sino que tienes que ser tu el que se las ingenie para reducir el ruido. Existen contadas cajas que lleven ventiladores de 120mm de serie por lo que casi seguro tendras que ser tu mismo el que los acople en dicha caja.
Respecto a lo de las corrientes de convencion como bien dices es bueno ,mas que poner una rejilla, poner un ventilador/es para que extraiga el aire caliente que por densidad y tal, se concetra en la parte superior de la caja.
Un saludo