Soy un negado en estos temas, pero si mal no recuerdo, aunque tengas la opcion wake on lan activada en la bios + tarjeta de red que lo admita+router/modemcable/etc… debes tener un cable que va desde la tarjeta de red (la circuiteria) hasta un conector de la placa base.
El conector es similar al que traen los cd roms/dvd roms/grabadoras de cd para poder usar el cd rom como reproductor de audio y que los cd de musica se escuchen por los altavoces, pero más corto (menos pins).
Si eso siempre puedes coger y el propio interruptor que tienes en la fuente de alimentación, apagarlo, y así te evitarás estos problemas.