Haz una imagen de la particion del sistema de c:\ del hd ide, no del disco completo.
Copiala al disco sata a una particion de datos.
Desconecta el disco ide.
Restaura la imagen a la particion c:\ del disco sata y que esta sea la particion activa.Tiene que funcionar asi.
PD: no mencionas que placa tienes, supongo que tendra soporte nativo sata, osea que para la instalacion de Windows no haya que instalar los drivers para sata de un diskete, porque si es asi ahi estaria el problema de porque no te funciona.
Un saludo.
Asus A8N DELUXE