Amigo quique, he sacado este texto del manual de Partition Magic:
Windows NT/2000/XP deben arrancar desde una partición primaria en la primera unidad. Sin embargo, sólo unos pocos archivos de Windows NT/2000/XP deben estar ubicados en esa partición: los archivos restantes pueden residir en una partición lógica ubicada en la primera unidad o en otra posterior. La partición de arranque de Windows NT/2000/XP puede compartirse con otro sistema operativo. Además, Windows NT debe estar instalado en una partición FAT y Windows 2000/XP en una partición FAT o FAT32. Durante la instalación, puede convertir la partición en NTFS.
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Saludos 😉