Bueno en realidad pulsar la tecla F5 en la preinstalacion viene indocumentado y hace que te salgan unas opciones que de otro modo no saldrian para elegir el tipo de equipo, pero ahora que veo eso igual no te sirve.
Prueba dejar los discos con el jumper colocado en cable select, pero asegurate antes de que los cables sean de 80 conductores. Si tus cables son de 40 hilos asegurate de colocar un disco como maestro y otro como esclavo. Te los deberia reconocer por lo menos, si no lo hace no creo que se deba a las opciones de la bios que yo en tu caso dejaria en default y mas habiendo problemas.
Viendo la foto esta placa tiene 2 zocalos para conectar 2 discos IDE tipo PATA en modo raid, y el otro conector, el de arriba junto al de la disquetera sera para el CD o DVD, creo que siendo así debes ir a la bios e indicar que deseas mantener activada la controladora IDE () pero que no deseas mantenerlo en modo raid.
Claro es que estas placas tan modernas empiezan a quitar protagonismo a los discos IDE de toda la vida.