Yo en tu caso me compraria la tarjeta AGP y ya esta, porque ahora hacer una inversion algo mas importante para conseguir una tarjeta PCIe que en el futuro no soportara de manera nativa dx10, no se, lo veo algo suicida con todos mis respetos.
Solo lo haria en el caso en que consiguiera una tarjeta PCIe y una placa madre con soporte por el precio de la grafica AGP, cosa bastante improbable, o poner algo mas y conseguir una grafica bastante mas potente.
Pero es que aun y asi lo veo chungo, porque la grafica PCIe en un futuro en que te cambies de ordenata te hara de cuello de botella, porque como saquen mas juegos tipo "Oblivion", se te van a zampar a la grafica, aunque sea un caso muy concreto :risitas: Mas que nada lo digo porque si te compras un peazo ordenata que tire un monton (en plan el Core 2 Duo pero que rinda como teoricamente rinde), con memoria RAM con buenos timings y to eso, se te va a quedar corta y pensaras en comprarte otra.
Lo que no estoy muy seguro es del ancho de banda del PCIe, pues en un principio se demostro que bastaba el caudal de datos que proporcionaba el puerto AGP, pues las primeras tarjetas PCIe rendian lo mismo. Supongo que hoy en dia y viendo los monstruos de tarjetas que rondan por ahi, el AGP se debe quedar corto, pero esto creo que lo podra aclarar algun experto de estos que rondan el foro 
Finalmente y completando lo que ha dicho Dakk3r, hace unos años habia tarjetas AGP 1x y 2x, que de hecho no son compatibles hoy en dia con la mayoria de las placas madre por una diferencia en el voltaje de funcionamiento, por eso estan obsoletas.
Tarjetas PCI no he visto en esta ultima generacion O_o, las ultimas que vi eran GeForce FX, supongo que porque el ancho de banda del slot no debe dar mucho de si 
Hace mas años todavia, existia un slot llamado ISA, que tambien permitia la conexion de tarjetas graficas, pues en esos años no habia un puerto especifico para graficos tipo AGP o PCIe 16x, y se podian enchufar varias graficas a la vez :sisi: .
Este slot se amplio y paso a llamarse E-ISA (Extended Industry Standard Architecture), aunque me parece que no triunfo mucho, porque las tarjetas tenian que ser mas largas (era un poco mas corto que la caja de un ordenata!) y debia ser algo mas caro fabricarlo/las, asi que debio utilizarse principalmente en aplicaciones graficas o servidores, cosas de esa epoca que no tengo por aqui ;D
Bueno espero que a parte de torrarla con batallitas y tal te haya aclarado (o liado) el tema 