Si sospechas que el Sistema está corrupto por trasteo o simplemente porque tiene mucho tiempo es una buena forma de descartar problemas de soft, por supuesto descargar los últimos drivers también es importante. No es cuestión de enviar una tarjeta en buen estado a RMA.
Si fuera cosa de CPU deberías ver también la caída de FPS. Prueba a medir con el bench de min/max/avg del FRAPS para comprobar mínimos y a relajar detalles si eso. Si es on-line asegúrate de que no es cosa de conexión.
PD: Antes de formatear hazle imagen al Sistema no sea que te quedes igual y te toque enchufar todo otra vez.