Si puedes intenta hacer una cosa, con la gráfica desmontada del PC prueba a meterle aire (por ejemplo usa un spray de aire comprimido) por la zona del ventilador para comprobar si hay polvo o pelusas en el interior. Parece una tontería, pero si hay un poco de polvo pegado en las paredes internas del disipador la temperatura sube, y si son pelusas la cosa se puede poner peligrosa. No es peligroso porque el disipador es hueco y no tiene componentes que puedan sufrir presión del aire. Eso sí, intenta mantener parado el ventilador con los dedos mientras metas aire, los ventiladores no aguantan bien los chorros de aire directos.
El disipador de las GTX295 de doble PCB es un bloque con aletas internas que lleva montados los dos PCB en sandwich, uno a cada lado, interconectados por una especie de SLI interno. Tiene complejidad desmontarlo pero no tanto como para cargárselo si tienes suficiente maña. Ya he desmontado un par de 9800GX2, similares en disipación a la GTX295 y salgo la ingente cantidad de tornillos a quitar, por lo demás no es difícil.
Por cierto, por lo que tengo entendido se le puede poner a tu tarjeta un backplate que mejora la disipación y baja un poco las temperaturas. Mira a ver si se puede encontrar uno por ahí.
A ver si así la cosa mejora mientras no se desmonte por completo la tarjeta.
Saludotes varios.