¿Un modelo de Gigabyte? ¿No será una ECS (EliteGroup)?
Además esta acepta PCI-Express en modo nativo, no como las que tu dices… esas unen dos buses PCI "normales" para formar un PCI-Express, vamos que es una chapuza del tres al cuarto, y el rendimiento es malísimo (tienen un ancho de banda de 256 MB/s frente a los 8 GBs/s de un PCI-Express 16x).