Ahí esta la gracia, yo probé varios y el disco estaba bien supongo que es por que estos programas miran la superficie del disco y esto es mas fallo electrónico o mecánico que otra cosa, no se igual lo que te pasa a ti no es lo mismo, yo oía el típico clec de cuando recoge los cabezales un ummmmmmmmm como si frenase los discos y después el típico aceleron de cuando se ponen en marcha.
edito: prueba el HDDlife Pro (creo que era este) tiene una versión de evaluación de 30 días me parece que a mi me daba una alerta de rendimiento pero no lo recuerdo muy bien.