¿No sera que esta caducado el certificado del DNI? No tenia ni idea de que se caducaban hasta que fui a utilizarlo hace un par de años para presentar una solicitud, compre un lector y no había forma de que funcionara. Me enteré de que los certificados caducan cada dos años, con lo que deberías ir a una comisaria consultar, en principio si es un DNI de los últimos(o no se que modelo concreto) podrías actualizarlo en una especie de maquina tu solo, pero si no deberías pedir cita para que te lo hagan.
Te comento esto por si acaso es este el problema...mas que nada por que por muchos lectores utilices, si el certificado ha caducado no podrás hacer nada.
Saludos!!