Shilmar colega, segun lo que apuntas, creo que estás en lo cierto, si el core está bien calentito por detras, mas que el disipa, quiere decir que éste no realiza bien su funcion, asi que lo que yo haría es ver si está bien colocado, o en su defecto, quitarlo y darle una raspadita al chipset (adios garantia) para que todo esté al mismo nivel, ya que en las graficas de nvidia es bastante normal éste fallo que mencionas, en el que el core se hunde por su parte central, dejando el nucleo, bastante lejos del disipa.
Saludos y suerte