Por fin…
Ya puedo ver uno de los SATA desde mi disco de windows, ya me extrañaba a mi, ¿cómo es posible que desde linux no tenga ningún problema y desde windows no pueda?, la clave estaba en el mismo disco.
Lo que he hecho ha sido despincchar el disco de la placa, reinstalar los drivers, cuando he visto que no había conflictos después de hacer algunas pruebas he vuelto a picar el HDD y "VOILA", sin problemas.
Muchas gracias a todos, y sobre todo a ti FASSOU, que me sugeriste que fuese quitando dispositivos, que fue lo que medio la idea.